Le classement de l'université de Shanghai est basé sur de nombreux critères comme le nombre d'enseignants ou d'anciens "Nobelisés", ou les travaux de recherche publiés en anglais.

En 2008, seules 9 universités françaises figurent parmi les 100 meilleures dans le monde. Moins bien que les Pays-Bas ou Israël.

Cette contre-performance française s'explique en partie par le fait que les grandes écoles ne sont pas prises en compte. Par ailleurs, les chercheurs hexagonaux signent souvent leurs travaux "CNRS".

Du coup, les critères de l'université Jiao Tong sont contestés en France. En attendant ce classement nuit à la réputation des facs françaises auprès des universitaires du monde entier.